將標記有熒光素的Taqman探針與(yu) 模板DNA混合後,完成高溫變性,低溫複性,適溫延伸的熱循環,並遵守聚合酶鏈反應規律,與(yu) 模板DNA互補配對的Taqman探針被切斷,熒光素遊離於(yu) 反應體(ti) 係中,在特定光激發下發出熒光,隨著循環次數的增加,被擴增的目的基因片段呈指數規律增長,通過實時檢測與(yu) 之對應的隨擴增而變化熒光信號強度,求得Ct值,同時利用數個(ge) 已知模板濃度的標準品作對照,即可得出待測標本目的基因的拷貝數。
Ct值(Cyclethreshold,循環閾值)的含義(yi) 為(wei) :每個(ge) 反應管內(nei) 的熒光信號到達設定閾值時所經曆的循環數。
1. 熒光閾值(threshold)的設定
PCR反應的前15個(ge) 循環的熒光信號作為(wei) 熒光本底信號,熒光閾值的缺省(默認)設置是3-15個(ge) 循環的熒光信號的標準偏差的10倍,即:threshold= 10*SDcycle 3-15
2. Ct值與(yu) 起始模板的關(guan) 係
每個(ge) 模板的Ct值與(yu) 該模板的起始拷貝數的對數存在線性關(guan) 係,公式如下。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)
n為(wei) 擴增反應的循環次數,X0為(wei) 初始模板量,Ex為(wei) 擴增效率,N為(wei) 熒光擴增信號達到閾值強度時擴增產(chan) 物的量。
起始拷貝數越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數的對數,縱坐標代Ct值。因此,隻要獲得未知樣品的Ct值,即可從(cong) 標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數。
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